1997年6月25日，清華同方股份有限公司正式成立。 1997年6月27日，清華同方在上海證券交易所鳴鑼上市。 2006年5月30日，清華同方股份有限公司更名為“同方股份有限公司”。2019年12月30日，中國核工業(yè)集團(tuán)資本控股有限公司通過股權(quán)收購，獲得同方股份21%的股權(quán)，成為同方股份的控股股東，同方股份實(shí)際控制人由教育部變更為國務(wù)院國資委。

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